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肿瘤SNV 1-25% gDNA标准品
货号 |
单位规格 |
库存 |
浓度 |
GW-OGTM004 |
1 µg/支 |
9999 |
30 ng/µL |
二代测序(NGS)平台是目前基于测序手段研究人类基因组的最主要平台。然而,由于样本差异,建库方法不同,测序平台偏差,生物信息分析流程各异等一系列因素的限制,结果准确性没有统一标准。 菁良基因的多重组合标准品适用于 NGS 全过程:从文库制备,上机测序,到信息分析;同时适用于各测序方法:全基因组,全外显子组,目标区域,定制捕获和靶向扩增子组等测序。
肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品是一种高度特征化,生物学相关的质量控制材料,涵盖多个基因变异,包含了经过 ddPCR 验证的9个 SNV 和1个缺失突变位点,用于评估 NGS 流程的性能,有助于修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等,并进行后续的一系列应用。
浓度 |
30 ng/uL |
保存溶剂 |
Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0 |
存储温度 |
2-8˚C |
保质期 |
36个月 |
规格 |
1 µg/支 |
检测项目 |
检测方法 |
质量标准 |
等位基因突变频率/基因型 |
微滴式数字PCR |
AF=0%, 可接受范围 ≤0.1%
AF<5%,可接受误差范围 = ±30%
5%≤AF<10%, 可接受误差范围 = ±20%
10%≤AF, 可接受误差范围 = ±10% |
完整性 |
琼脂糖凝胶电泳 |
电泳条带单一,明亮 |
浓度 |
分光光度法(A260) |
45-55 ng/µl |
序号 |
突变类型 |
基因位点 |
CDS突变 |
突变频率/拷贝数 |
COSMIC编号 (COSMIC v96) |
染色体编号 |
染色体位置(GRCh38) |
1 |
SNV |
BRAF V600E |
c.1799T>A |
10.5% |
COSM476 |
7 |
140753336 |
2 |
SNV |
EGFR G719S |
c.2155G>A |
24.5% |
COSM6252 |
7 |
55174014 |
3 |
SNV |
EGFR L858R |
c.2573T>G |
3.0% |
COSM6224 |
7 |
55191822 |
4 |
SNV |
EGFR T790M |
c.2369C>T |
1.0% |
COSM6240 |
7 |
55181378 |
5 |
Deletion |
EGFR E746_A750del |
c.2235_2249del15 |
2.0% |
COSM6223 |
7 |
55174772-55174786 |
6 |
SNV |
KRAS G12D |
c.35G>A |
6.0% |
COSM521 |
12 |
25245350 |
7 |
SNV |
KRAS G13D |
c.38G>A |
15.0% |
COSM532 |
12 |
25245347 |
8 |
SNV |
NRAS Q61K |
c.181C>A |
12.5% |
COSM580 |
1 |
114713909 |
9 |
SNV |
PIK3CA E545K |
c.1633G>A |
9.0% |
COSM763 |
3 |
179218303 |
10 |
SNV |
PIK3CA H1047R |
c.3140A>G |
17.5% |
COSM775 |
3 |
179234297 |
- 评估检测流程的效率
-
评估背景噪声对变异检测的影响
-
验证生物信息学流程的稳健性
-
优化和验证新的癌症panels,并监测流程性能
-
探测流程的监测限和定量限
-
分析检测流程的灵敏度,准确度和特异性
-
比较各平台的检测差异
以下文件命名格式为产品货号-产品批次号-产品文件类型
GW-OGTM004-产品说明书-V2: |
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GW-OGTM004-201810005-COA: |
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GW-OGTM004-201810005-数字PCR实测值: |
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GW-OGTM004-201910001-COA: |
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GW-OGTM004-201910001-数字PCR实测值: |
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GW-OGTM004-201911001-COA: |
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GW-OGTM004-201911001-数字PCR实测值: |
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GW-OGTM004-202306211-COA: |
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